Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNIKQ9UKE5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
TNIKQ9UKE5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms