Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sntg1Q925E1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms