Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC18A3Q16572 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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