Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP19O94966 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP19O94966 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP19O94966 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP19O94966 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP19O94966 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP19O94966 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP19O94966 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP19O94966 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP19O94966 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP19O94966 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP19O94966 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP19O94966 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP19O94966 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP19O94966 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
USP19O94966 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP19O94966 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP19O94966 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP19O94966 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP19O94966 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP19O94966 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP19O94966 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP19O94966 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP19O94966 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP19O94966 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
USP19O94966 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
USP19O94966 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP19O94966 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP19O94966 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP19O94966 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP19O94966 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP19O94966 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP19O94966 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP19O94966 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP19O94966 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
USP19O94966 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29■■■□□ 2.23
USP19O94966 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP19O94966 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP19O94966 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
USP19O94966 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29■■■□□ 2.23
USP19O94966 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP19O94966 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP19O94966 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29■■■□□ 2.23
USP19O94966 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP19O94966 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP19O94966 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP19O94966 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP19O94966 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP19O94966 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP19O94966 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP19O94966 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP19O94966 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP19O94966 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP19O94966 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP19O94966 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP19O94966 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP19O94966 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP19O94966 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP19O94966 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP19O94966 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP19O94966 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP19O94966 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP19O94966 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP19O94966 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP19O94966 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP19O94966 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP19O94966 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP19O94966 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP19O94966 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP19O94966 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP19O94966 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP19O94966 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP19O94966 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
USP19O94966 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP19O94966 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
USP19O94966 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP19O94966 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP19O94966 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP19O94966 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP19O94966 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP19O94966 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP19O94966 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP19O94966 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP19O94966 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP19O94966 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP19O94966 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP19O94966 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP19O94966 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP19O94966 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP19O94966 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP19O94966 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP19O94966 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
USP19O94966 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP19O94966 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
USP19O94966 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP19O94966 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms