Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim25Q61510 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim25Q61510 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms