Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
2610001J05RikF2Z3Y9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
2610001J05RikF2Z3Y9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms