Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3glb1Q9JK48 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sh3glb1Q9JK48 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms