Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RUNX3Q13761 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNX3Q13761 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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