Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rom1P32958 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rom1P32958 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rom1P32958 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rom1P32958 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rom1P32958 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rom1P32958 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rom1P32958 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rom1P32958 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rom1P32958 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rom1P32958 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rom1P32958 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rom1P32958 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rom1P32958 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rom1P32958 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rom1P32958 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rom1P32958 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rom1P32958 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rom1P32958 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rom1P32958 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rom1P32958 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rom1P32958 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rom1P32958 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rom1P32958 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rom1P32958 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rom1P32958 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rom1P32958 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rom1P32958 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rom1P32958 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rom1P32958 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rom1P32958 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rom1P32958 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rom1P32958 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rom1P32958 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rom1P32958 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rom1P32958 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rom1P32958 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rom1P32958 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rom1P32958 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rom1P32958 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rom1P32958 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rom1P32958 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rom1P32958 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rom1P32958 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rom1P32958 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rom1P32958 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rom1P32958 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rom1P32958 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rom1P32958 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rom1P32958 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rom1P32958 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rom1P32958 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Rom1P32958 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rom1P32958 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rom1P32958 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Rom1P32958 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rom1P32958 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rom1P32958 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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