Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SETD1BQ9UPS6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SETD1BQ9UPS6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SETD1BQ9UPS6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SETD1BQ9UPS6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SETD1BQ9UPS6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SETD1BQ9UPS6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SETD1BQ9UPS6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SETD1BQ9UPS6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
SETD1BQ9UPS6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SETD1BQ9UPS6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SETD1BQ9UPS6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SETD1BQ9UPS6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SETD1BQ9UPS6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SETD1BQ9UPS6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms