Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prkrip1Q9CWV6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkrip1Q9CWV6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkrip1Q9CWV6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms