Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA3CQ99985 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA3CQ99985 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms