Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC82Q8N4S0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC82Q8N4S0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms