Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Slit2Q9R1B9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Slit2Q9R1B9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Slit2Q9R1B9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Slit2Q9R1B9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Slit2Q9R1B9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Slit2Q9R1B9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Slit2Q9R1B9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Slit2Q9R1B9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Slit2Q9R1B9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Slit2Q9R1B9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Slit2Q9R1B9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Slit2Q9R1B9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Slit2Q9R1B9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Slit2Q9R1B9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Slit2Q9R1B9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Slit2Q9R1B9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Slit2Q9R1B9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Slit2Q9R1B9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Slit2Q9R1B9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Slit2Q9R1B9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Slit2Q9R1B9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Slit2Q9R1B9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Slit2Q9R1B9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Slit2Q9R1B9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Slit2Q9R1B9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Slit2Q9R1B9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Slit2Q9R1B9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Slit2Q9R1B9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Slit2Q9R1B9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Slit2Q9R1B9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Slit2Q9R1B9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Slit2Q9R1B9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Slit2Q9R1B9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Slit2Q9R1B9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Slit2Q9R1B9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Slit2Q9R1B9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Slit2Q9R1B9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Slit2Q9R1B9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Slit2Q9R1B9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Slit2Q9R1B9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Slit2Q9R1B9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Slit2Q9R1B9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Slit2Q9R1B9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Slit2Q9R1B9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Slit2Q9R1B9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Slit2Q9R1B9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Slit2Q9R1B9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Slit2Q9R1B9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Slit2Q9R1B9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Slit2Q9R1B9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Slit2Q9R1B9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Slit2Q9R1B9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Slit2Q9R1B9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Slit2Q9R1B9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Slit2Q9R1B9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Slit2Q9R1B9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Slit2Q9R1B9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Slit2Q9R1B9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Slit2Q9R1B9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Slit2Q9R1B9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Slit2Q9R1B9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Slit2Q9R1B9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Slit2Q9R1B9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Slit2Q9R1B9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Slit2Q9R1B9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Slit2Q9R1B9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Slit2Q9R1B9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Slit2Q9R1B9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Slit2Q9R1B9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Slit2Q9R1B9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Slit2Q9R1B9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Slit2Q9R1B9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Slit2Q9R1B9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Slit2Q9R1B9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Slit2Q9R1B9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Slit2Q9R1B9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Slit2Q9R1B9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Slit2Q9R1B9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Slit2Q9R1B9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Slit2Q9R1B9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Slit2Q9R1B9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Slit2Q9R1B9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Slit2Q9R1B9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Slit2Q9R1B9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Slit2Q9R1B9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Slit2Q9R1B9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Slit2Q9R1B9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Slit2Q9R1B9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Slit2Q9R1B9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Slit2Q9R1B9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Slit2Q9R1B9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Slit2Q9R1B9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Slit2Q9R1B9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Slit2Q9R1B9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Slit2Q9R1B9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Slit2Q9R1B9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Slit2Q9R1B9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Slit2Q9R1B9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Slit2Q9R1B9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms