Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SacsQ9JLC8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SacsQ9JLC8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SacsQ9JLC8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SacsQ9JLC8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SacsQ9JLC8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SacsQ9JLC8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SacsQ9JLC8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms