Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK2

Pacrg, Parkin coregulated gene protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrgQ9DAK2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PacrgQ9DAK2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PacrgQ9DAK2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PacrgQ9DAK2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PacrgQ9DAK2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PacrgQ9DAK2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PacrgQ9DAK2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PacrgQ9DAK2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PacrgQ9DAK2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PacrgQ9DAK2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PacrgQ9DAK2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PacrgQ9DAK2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PacrgQ9DAK2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PacrgQ9DAK2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PacrgQ9DAK2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PacrgQ9DAK2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PacrgQ9DAK2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PacrgQ9DAK2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PacrgQ9DAK2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PacrgQ9DAK2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PacrgQ9DAK2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PacrgQ9DAK2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PacrgQ9DAK2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PacrgQ9DAK2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PacrgQ9DAK2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PacrgQ9DAK2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PacrgQ9DAK2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PacrgQ9DAK2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PacrgQ9DAK2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PacrgQ9DAK2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PacrgQ9DAK2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PacrgQ9DAK2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PacrgQ9DAK2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PacrgQ9DAK2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PacrgQ9DAK2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PacrgQ9DAK2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PacrgQ9DAK2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PacrgQ9DAK2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PacrgQ9DAK2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PacrgQ9DAK2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PacrgQ9DAK2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PacrgQ9DAK2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PacrgQ9DAK2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PacrgQ9DAK2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PacrgQ9DAK2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PacrgQ9DAK2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PacrgQ9DAK2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PacrgQ9DAK2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PacrgQ9DAK2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PacrgQ9DAK2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PacrgQ9DAK2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PacrgQ9DAK2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PacrgQ9DAK2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PacrgQ9DAK2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PacrgQ9DAK2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PacrgQ9DAK2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PacrgQ9DAK2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PacrgQ9DAK2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PacrgQ9DAK2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PacrgQ9DAK2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PacrgQ9DAK2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PacrgQ9DAK2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PacrgQ9DAK2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PacrgQ9DAK2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PacrgQ9DAK2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PacrgQ9DAK2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PacrgQ9DAK2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PacrgQ9DAK2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PacrgQ9DAK2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PacrgQ9DAK2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PacrgQ9DAK2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PacrgQ9DAK2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PacrgQ9DAK2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PacrgQ9DAK2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PacrgQ9DAK2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PacrgQ9DAK2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PacrgQ9DAK2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PacrgQ9DAK2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PacrgQ9DAK2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PacrgQ9DAK2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PacrgQ9DAK2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PacrgQ9DAK2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PacrgQ9DAK2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PacrgQ9DAK2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PacrgQ9DAK2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PacrgQ9DAK2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PacrgQ9DAK2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PacrgQ9DAK2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PacrgQ9DAK2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PacrgQ9DAK2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PacrgQ9DAK2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PacrgQ9DAK2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PacrgQ9DAK2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PacrgQ9DAK2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PacrgQ9DAK2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PacrgQ9DAK2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PacrgQ9DAK2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PacrgQ9DAK2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PacrgQ9DAK2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PacrgQ9DAK2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms