Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I6

Wdsub1, WD repeat, SAM and U-box domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdsub1Q9D0I6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Wdsub1Q9D0I6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Wdsub1Q9D0I6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Wdsub1Q9D0I6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Wdsub1Q9D0I6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Wdsub1Q9D0I6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Wdsub1Q9D0I6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdsub1Q9D0I6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Wdsub1Q9D0I6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Wdsub1Q9D0I6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Wdsub1Q9D0I6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Wdsub1Q9D0I6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdsub1Q9D0I6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Wdsub1Q9D0I6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Wdsub1Q9D0I6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Wdsub1Q9D0I6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wdsub1Q9D0I6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wdsub1Q9D0I6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Wdsub1Q9D0I6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Wdsub1Q9D0I6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Wdsub1Q9D0I6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Wdsub1Q9D0I6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdsub1Q9D0I6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Wdsub1Q9D0I6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdsub1Q9D0I6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdsub1Q9D0I6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdsub1Q9D0I6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Wdsub1Q9D0I6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wdsub1Q9D0I6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wdsub1Q9D0I6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Wdsub1Q9D0I6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdsub1Q9D0I6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdsub1Q9D0I6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdsub1Q9D0I6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdsub1Q9D0I6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdsub1Q9D0I6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Wdsub1Q9D0I6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Wdsub1Q9D0I6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Wdsub1Q9D0I6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdsub1Q9D0I6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdsub1Q9D0I6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Wdsub1Q9D0I6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Wdsub1Q9D0I6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdsub1Q9D0I6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Wdsub1Q9D0I6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdsub1Q9D0I6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdsub1Q9D0I6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Wdsub1Q9D0I6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdsub1Q9D0I6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdsub1Q9D0I6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Wdsub1Q9D0I6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdsub1Q9D0I6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdsub1Q9D0I6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdsub1Q9D0I6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdsub1Q9D0I6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdsub1Q9D0I6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdsub1Q9D0I6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdsub1Q9D0I6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdsub1Q9D0I6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdsub1Q9D0I6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdsub1Q9D0I6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdsub1Q9D0I6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdsub1Q9D0I6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdsub1Q9D0I6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdsub1Q9D0I6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdsub1Q9D0I6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdsub1Q9D0I6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdsub1Q9D0I6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdsub1Q9D0I6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdsub1Q9D0I6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdsub1Q9D0I6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdsub1Q9D0I6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdsub1Q9D0I6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdsub1Q9D0I6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Wdsub1Q9D0I6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdsub1Q9D0I6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdsub1Q9D0I6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdsub1Q9D0I6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdsub1Q9D0I6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdsub1Q9D0I6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdsub1Q9D0I6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdsub1Q9D0I6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdsub1Q9D0I6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdsub1Q9D0I6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdsub1Q9D0I6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdsub1Q9D0I6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdsub1Q9D0I6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdsub1Q9D0I6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdsub1Q9D0I6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdsub1Q9D0I6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdsub1Q9D0I6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdsub1Q9D0I6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wdsub1Q9D0I6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wdsub1Q9D0I6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdsub1Q9D0I6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdsub1Q9D0I6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Wdsub1Q9D0I6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Wdsub1Q9D0I6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Wdsub1Q9D0I6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Wdsub1Q9D0I6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms