Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
PtprtQ99M80 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
PtprtQ99M80 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
PtprtQ99M80 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PtprtQ99M80 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
PtprtQ99M80 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
PtprtQ99M80 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
PtprtQ99M80 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PtprtQ99M80 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
PtprtQ99M80 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
PtprtQ99M80 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC40.95■■■■■ 4.15
PtprtQ99M80 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
PtprtQ99M80 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
PtprtQ99M80 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
PtprtQ99M80 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
PtprtQ99M80 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
PtprtQ99M80 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
PtprtQ99M80 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
PtprtQ99M80 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
PtprtQ99M80 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
PtprtQ99M80 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PtprtQ99M80 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PtprtQ99M80 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PtprtQ99M80 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PtprtQ99M80 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
PtprtQ99M80 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
PtprtQ99M80 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
PtprtQ99M80 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
PtprtQ99M80 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
PtprtQ99M80 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
PtprtQ99M80 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
PtprtQ99M80 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PtprtQ99M80 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
PtprtQ99M80 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
PtprtQ99M80 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PtprtQ99M80 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
PtprtQ99M80 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
PtprtQ99M80 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PtprtQ99M80 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
PtprtQ99M80 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PtprtQ99M80 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PtprtQ99M80 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
PtprtQ99M80 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
PtprtQ99M80 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PtprtQ99M80 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PtprtQ99M80 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
PtprtQ99M80 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
PtprtQ99M80 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
PtprtQ99M80 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
PtprtQ99M80 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
PtprtQ99M80 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
PtprtQ99M80 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
PtprtQ99M80 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PtprtQ99M80 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
PtprtQ99M80 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
PtprtQ99M80 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
PtprtQ99M80 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PtprtQ99M80 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PtprtQ99M80 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
PtprtQ99M80 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
PtprtQ99M80 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PtprtQ99M80 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PtprtQ99M80 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
PtprtQ99M80 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PtprtQ99M80 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PtprtQ99M80 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
PtprtQ99M80 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PtprtQ99M80 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
PtprtQ99M80 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
PtprtQ99M80 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PtprtQ99M80 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PtprtQ99M80 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
PtprtQ99M80 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
PtprtQ99M80 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PtprtQ99M80 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PtprtQ99M80 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PtprtQ99M80 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PtprtQ99M80 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
PtprtQ99M80 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
PtprtQ99M80 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PtprtQ99M80 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
PtprtQ99M80 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
PtprtQ99M80 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PtprtQ99M80 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PtprtQ99M80 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PtprtQ99M80 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PtprtQ99M80 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PtprtQ99M80 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PtprtQ99M80 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PtprtQ99M80 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PtprtQ99M80 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC40.04■■■■■ 4
PtprtQ99M80 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PtprtQ99M80 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
PtprtQ99M80 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
PtprtQ99M80 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PtprtQ99M80 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PtprtQ99M80 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PtprtQ99M80 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PtprtQ99M80 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PtprtQ99M80 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
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