Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SptssbQ925E8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SptssbQ925E8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SptssbQ925E8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SptssbQ925E8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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