Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
6430531B16RikQ3V2J1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
6430531B16RikQ3V2J1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
6430531B16RikQ3V2J1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
6430531B16RikQ3V2J1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
6430531B16RikQ3V2J1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
6430531B16RikQ3V2J1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
6430531B16RikQ3V2J1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
6430531B16RikQ3V2J1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
6430531B16RikQ3V2J1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
6430531B16RikQ3V2J1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
6430531B16RikQ3V2J1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
6430531B16RikQ3V2J1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
6430531B16RikQ3V2J1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
6430531B16RikQ3V2J1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
6430531B16RikQ3V2J1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
6430531B16RikQ3V2J1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
6430531B16RikQ3V2J1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
6430531B16RikQ3V2J1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
6430531B16RikQ3V2J1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
6430531B16RikQ3V2J1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
6430531B16RikQ3V2J1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
6430531B16RikQ3V2J1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
6430531B16RikQ3V2J1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
6430531B16RikQ3V2J1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
6430531B16RikQ3V2J1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
6430531B16RikQ3V2J1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
6430531B16RikQ3V2J1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
6430531B16RikQ3V2J1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
6430531B16RikQ3V2J1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
6430531B16RikQ3V2J1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
6430531B16RikQ3V2J1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
6430531B16RikQ3V2J1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
6430531B16RikQ3V2J1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
6430531B16RikQ3V2J1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
6430531B16RikQ3V2J1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
6430531B16RikQ3V2J1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
6430531B16RikQ3V2J1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
6430531B16RikQ3V2J1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
6430531B16RikQ3V2J1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
6430531B16RikQ3V2J1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
6430531B16RikQ3V2J1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
6430531B16RikQ3V2J1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
6430531B16RikQ3V2J1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
6430531B16RikQ3V2J1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
6430531B16RikQ3V2J1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
6430531B16RikQ3V2J1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
6430531B16RikQ3V2J1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
6430531B16RikQ3V2J1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
6430531B16RikQ3V2J1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
6430531B16RikQ3V2J1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
6430531B16RikQ3V2J1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
6430531B16RikQ3V2J1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
6430531B16RikQ3V2J1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
6430531B16RikQ3V2J1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
6430531B16RikQ3V2J1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
6430531B16RikQ3V2J1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
6430531B16RikQ3V2J1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
6430531B16RikQ3V2J1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
6430531B16RikQ3V2J1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
6430531B16RikQ3V2J1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
6430531B16RikQ3V2J1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
6430531B16RikQ3V2J1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
6430531B16RikQ3V2J1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
6430531B16RikQ3V2J1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
6430531B16RikQ3V2J1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
6430531B16RikQ3V2J1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
6430531B16RikQ3V2J1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
6430531B16RikQ3V2J1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
6430531B16RikQ3V2J1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
6430531B16RikQ3V2J1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
6430531B16RikQ3V2J1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
6430531B16RikQ3V2J1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
6430531B16RikQ3V2J1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms