Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
B230104I21RikQ3USW4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
B230104I21RikQ3USW4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
B230104I21RikQ3USW4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
B230104I21RikQ3USW4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
B230104I21RikQ3USW4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
B230104I21RikQ3USW4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
B230104I21RikQ3USW4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
B230104I21RikQ3USW4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
B230104I21RikQ3USW4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
B230104I21RikQ3USW4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
B230104I21RikQ3USW4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
B230104I21RikQ3USW4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
B230104I21RikQ3USW4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
B230104I21RikQ3USW4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
B230104I21RikQ3USW4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
B230104I21RikQ3USW4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
B230104I21RikQ3USW4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
B230104I21RikQ3USW4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
B230104I21RikQ3USW4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
B230104I21RikQ3USW4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
B230104I21RikQ3USW4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
B230104I21RikQ3USW4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
B230104I21RikQ3USW4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
B230104I21RikQ3USW4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
B230104I21RikQ3USW4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
B230104I21RikQ3USW4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
B230104I21RikQ3USW4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
B230104I21RikQ3USW4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
B230104I21RikQ3USW4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
B230104I21RikQ3USW4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
B230104I21RikQ3USW4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
B230104I21RikQ3USW4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
B230104I21RikQ3USW4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
B230104I21RikQ3USW4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
B230104I21RikQ3USW4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
B230104I21RikQ3USW4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
B230104I21RikQ3USW4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
B230104I21RikQ3USW4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
B230104I21RikQ3USW4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
B230104I21RikQ3USW4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
B230104I21RikQ3USW4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
B230104I21RikQ3USW4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
B230104I21RikQ3USW4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
B230104I21RikQ3USW4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
B230104I21RikQ3USW4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
B230104I21RikQ3USW4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
B230104I21RikQ3USW4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
B230104I21RikQ3USW4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
B230104I21RikQ3USW4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
B230104I21RikQ3USW4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
B230104I21RikQ3USW4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
B230104I21RikQ3USW4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
B230104I21RikQ3USW4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
B230104I21RikQ3USW4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
B230104I21RikQ3USW4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
B230104I21RikQ3USW4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
B230104I21RikQ3USW4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
B230104I21RikQ3USW4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
B230104I21RikQ3USW4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
B230104I21RikQ3USW4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
B230104I21RikQ3USW4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
B230104I21RikQ3USW4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
B230104I21RikQ3USW4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
B230104I21RikQ3USW4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
B230104I21RikQ3USW4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
B230104I21RikQ3USW4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
B230104I21RikQ3USW4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
B230104I21RikQ3USW4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
B230104I21RikQ3USW4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
B230104I21RikQ3USW4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
B230104I21RikQ3USW4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
B230104I21RikQ3USW4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
B230104I21RikQ3USW4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
B230104I21RikQ3USW4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
B230104I21RikQ3USW4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
B230104I21RikQ3USW4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
B230104I21RikQ3USW4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
B230104I21RikQ3USW4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
B230104I21RikQ3USW4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
B230104I21RikQ3USW4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
B230104I21RikQ3USW4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
B230104I21RikQ3USW4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
B230104I21RikQ3USW4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
B230104I21RikQ3USW4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
B230104I21RikQ3USW4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
B230104I21RikQ3USW4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
B230104I21RikQ3USW4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
B230104I21RikQ3USW4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
B230104I21RikQ3USW4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
B230104I21RikQ3USW4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
B230104I21RikQ3USW4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
B230104I21RikQ3USW4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
B230104I21RikQ3USW4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
B230104I21RikQ3USW4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
B230104I21RikQ3USW4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms