Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF7

Hivep2, Transcription factor HIVEP2, mousemouse

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep2Q3UHF7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hivep2Q3UHF7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hivep2Q3UHF7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hivep2Q3UHF7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hivep2Q3UHF7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hivep2Q3UHF7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hivep2Q3UHF7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hivep2Q3UHF7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hivep2Q3UHF7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hivep2Q3UHF7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hivep2Q3UHF7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hivep2Q3UHF7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hivep2Q3UHF7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hivep2Q3UHF7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hivep2Q3UHF7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hivep2Q3UHF7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hivep2Q3UHF7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Hivep2Q3UHF7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hivep2Q3UHF7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hivep2Q3UHF7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hivep2Q3UHF7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hivep2Q3UHF7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hivep2Q3UHF7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hivep2Q3UHF7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hivep2Q3UHF7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hivep2Q3UHF7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hivep2Q3UHF7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hivep2Q3UHF7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Hivep2Q3UHF7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hivep2Q3UHF7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hivep2Q3UHF7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hivep2Q3UHF7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hivep2Q3UHF7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hivep2Q3UHF7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hivep2Q3UHF7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hivep2Q3UHF7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hivep2Q3UHF7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hivep2Q3UHF7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hivep2Q3UHF7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hivep2Q3UHF7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hivep2Q3UHF7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hivep2Q3UHF7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hivep2Q3UHF7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hivep2Q3UHF7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hivep2Q3UHF7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hivep2Q3UHF7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hivep2Q3UHF7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hivep2Q3UHF7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hivep2Q3UHF7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hivep2Q3UHF7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hivep2Q3UHF7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hivep2Q3UHF7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hivep2Q3UHF7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hivep2Q3UHF7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hivep2Q3UHF7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hivep2Q3UHF7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hivep2Q3UHF7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hivep2Q3UHF7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hivep2Q3UHF7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hivep2Q3UHF7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hivep2Q3UHF7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hivep2Q3UHF7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hivep2Q3UHF7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hivep2Q3UHF7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hivep2Q3UHF7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hivep2Q3UHF7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hivep2Q3UHF7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hivep2Q3UHF7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hivep2Q3UHF7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hivep2Q3UHF7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hivep2Q3UHF7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hivep2Q3UHF7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hivep2Q3UHF7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hivep2Q3UHF7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hivep2Q3UHF7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hivep2Q3UHF7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hivep2Q3UHF7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hivep2Q3UHF7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hivep2Q3UHF7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hivep2Q3UHF7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hivep2Q3UHF7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hivep2Q3UHF7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hivep2Q3UHF7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hivep2Q3UHF7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hivep2Q3UHF7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hivep2Q3UHF7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hivep2Q3UHF7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hivep2Q3UHF7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hivep2Q3UHF7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hivep2Q3UHF7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hivep2Q3UHF7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hivep2Q3UHF7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hivep2Q3UHF7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hivep2Q3UHF7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hivep2Q3UHF7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hivep2Q3UHF7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hivep2Q3UHF7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hivep2Q3UHF7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hivep2Q3UHF7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hivep2Q3UHF7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms