Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 MIC10YCL057C-A 294 nt11.34□□□□□ -0.59
SRF1Q12516 BNA2YJR078W 1362 nt11.32□□□□□ -0.6
SRF1Q12516 YBR220CYBR220C 1683 nt11.32□□□□□ -0.6
SRF1Q12516 BMT5YIL096C 1011 nt11.3□□□□□ -0.6
SRF1Q12516 RIB1YBL033C 1038 nt11.29□□□□□ -0.6
SRF1Q12516 BMT6YLR063W 1098 nt11.25□□□□□ -0.61
SRF1Q12516 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.25□□□□□ -0.61
SRF1Q12516 YJL064WYJL064W 396 nt11.23□□□□□ -0.61
SRF1Q12516 YCR102CYCR102C 1107 nt11.22□□□□□ -0.61
SRF1Q12516 AVT6YER119C 1347 nt11.2□□□□□ -0.62
SRF1Q12516 ERG6YML008C 1152 nt11.2□□□□□ -0.62
SRF1Q12516 PAU5YFL020C 369 nt11.19□□□□□ -0.62
SRF1Q12516 YGR201CYGR201C 678 nt11.19□□□□□ -0.62
SRF1Q12516 SLG1YOR008C 1137 nt11.19□□□□□ -0.62
SRF1Q12516 NRT1YOR071C 1797 nt11.18□□□□□ -0.62
SRF1Q12516 YBR232CYBR232C 360 nt11.18□□□□□ -0.62
SRF1Q12516 YHL050CYHL050C 2094 nt11.18□□□□□ -0.62
SRF1Q12516 PAU19YMR325W 375 nt11.17□□□□□ -0.62
SRF1Q12516 PGC1YPL206C 966 nt11.17□□□□□ -0.62
SRF1Q12516 Q0144Q0144 330 nt11.16□□□□□ -0.62
SRF1Q12516 SOD2YHR008C 702 nt11.16□□□□□ -0.62
SRF1Q12516 AAC1YMR056C 930 nt11.16□□□□□ -0.62
SRF1Q12516 HHO1YPL127C 777 nt11.16□□□□□ -0.62
SRF1Q12516 MIC12YBR262C 321 nt11.15□□□□□ -0.62
SRF1Q12516 STP3YLR375W 1032 nt11.14□□□□□ -0.63
SRF1Q12516 Q0010Q0010 387 nt11.14□□□□□ -0.63
SRF1Q12516 LOT5YKL183W 921 nt11.13□□□□□ -0.63
SRF1Q12516 GOR1YNL274C 1053 nt11.13□□□□□ -0.63
SRF1Q12516 PEX2YJL210W 816 nt11.12□□□□□ -0.63
SRF1Q12516 TOM6YOR045W 186 nt11.1□□□□□ -0.63
SRF1Q12516 HIP1YGR191W 1812 nt11.09□□□□□ -0.63
SRF1Q12516 YIA6YIL006W 1122 nt11.09□□□□□ -0.63
SRF1Q12516 GND1YHR183W 1470 nt11.08□□□□□ -0.64
SRF1Q12516 MSB4YOL112W 1479 nt11.07□□□□□ -0.64
SRF1Q12516 QDR2YIL121W 1629 nt11.07□□□□□ -0.64
SRF1Q12516 BDF1YLR399C 2061 nt11.07□□□□□ -0.64
SRF1Q12516 LYS4YDR234W 2082 nt11.06□□□□□ -0.64
SRF1Q12516 MET28YIR017C 564 nt11.04□□□□□ -0.64
SRF1Q12516 TIR3YIL011W 810 nt11.03□□□□□ -0.64
SRF1Q12516 APT2YDR441C 546 nt11.01□□□□□ -0.65
SRF1Q12516 SRN2YLR119W 642 nt11.01□□□□□ -0.65
SRF1Q12516 SEM1YDR363W-A 270 nt11□□□□□ -0.65
SRF1Q12516 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt11□□□□□ -0.65
SRF1Q12516 SHH4YLR164W 507 nt11□□□□□ -0.65
SRF1Q12516 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.98□□□□□ -0.65
SRF1Q12516 RAX1YOR301W 1308 nt10.98□□□□□ -0.65
SRF1Q12516 YML089CYML089C 369 nt10.97□□□□□ -0.65
SRF1Q12516 FIT3YOR383C 615 nt10.97□□□□□ -0.65
SRF1Q12516 TIP1YBR067C 633 nt10.97□□□□□ -0.65
SRF1Q12516 ARA2YMR041C 1008 nt10.95□□□□□ -0.66
SRF1Q12516 POP2YNR052C 1302 nt10.93□□□□□ -0.66
SRF1Q12516 POM34YLR018C 900 nt10.92□□□□□ -0.66
SRF1Q12516 TAT1YBR069C 1860 nt10.91□□□□□ -0.66
SRF1Q12516 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.9□□□□□ -0.66
SRF1Q12516 RIB2YOL066C 1776 nt10.9□□□□□ -0.67
SRF1Q12516 TIF6YPR016C 738 nt10.89□□□□□ -0.67
SRF1Q12516 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt10.87□□□□□ -0.67
SRF1Q12516 NBP35YGL091C 987 nt10.86□□□□□ -0.67
SRF1Q12516 SMM1YNR015W 1155 nt10.86□□□□□ -0.67
SRF1Q12516 NCP1YHR042W 2076 nt10.86□□□□□ -0.67
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SRF1Q12516 SEC11YIR022W 504 nt10.85□□□□□ -0.67
SRF1Q12516 FRE6YLL051C 2139 nt10.83□□□□□ -0.68
SRF1Q12516 YLR122CYLR122C 378 nt10.83□□□□□ -0.68
SRF1Q12516 DUT1YBR252W 444 nt10.82□□□□□ -0.68
SRF1Q12516 PAC11YDR488C 1602 nt10.82□□□□□ -0.68
SRF1Q12516 ATG15YCR068W 1563 nt10.82□□□□□ -0.68
SRF1Q12516 NVJ2YPR091C 2313 nt10.81□□□□□ -0.68
SRF1Q12516 PRO1YDR300C 1287 nt10.81□□□□□ -0.68
SRF1Q12516 BUD20YLR074C 501 nt10.81□□□□□ -0.68
SRF1Q12516 ALD4YOR374W 1560 nt10.81□□□□□ -0.68
SRF1Q12516 LSC2YGR244C 1284 nt10.8□□□□□ -0.68
SRF1Q12516 MET8YBR213W 825 nt10.8□□□□□ -0.68
SRF1Q12516 ABZ2YMR289W 1125 nt10.79□□□□□ -0.68
SRF1Q12516 ARP10YDR106W 855 nt10.78□□□□□ -0.68
SRF1Q12516 PAR32YDL173W 888 nt10.75□□□□□ -0.69
SRF1Q12516 TAF13YML098W 504 nt10.75□□□□□ -0.69
SRF1Q12516 VRG4YGL225W 1014 nt10.72□□□□□ -0.69
SRF1Q12516 CCT5YJR064W 1689 nt10.7□□□□□ -0.7
SRF1Q12516 YCP4YCR004C 744 nt10.7□□□□□ -0.7
SRF1Q12516 HXT12YIL170W 1374 nt10.69□□□□□ -0.7
SRF1Q12516 BOP3YNL042W 1191 nt10.66□□□□□ -0.7
SRF1Q12516 ALP1YNL270C 1722 nt10.64□□□□□ -0.71
SRF1Q12516 PCH2YBR186W 1695 nt10.64□□□□□ -0.71
SRF1Q12516 THI72YOR192C 1800 nt10.64□□□□□ -0.71
SRF1Q12516 FCY21YER060W 1587 nt10.64□□□□□ -0.71
SRF1Q12516 TOS1YBR162C 1368 nt10.64□□□□□ -0.71
SRF1Q12516 AGP1YCL025C 1902 nt10.62□□□□□ -0.71
SRF1Q12516 YJL225CYJL225C 5277 nt10.62□□□□□ -0.71
SRF1Q12516 SAM50YNL026W 1455 nt10.61□□□□□ -0.71
SRF1Q12516 KRE1YNL322C 942 nt10.6□□□□□ -0.71
SRF1Q12516 GUT2YIL155C 1950 nt10.59□□□□□ -0.71
SRF1Q12516 PRY1YJL079C 900 nt10.59□□□□□ -0.71
SRF1Q12516 AQY2YLL052C 450 nt10.58□□□□□ -0.72
SRF1Q12516 YMR262WYMR262W 942 nt10.58□□□□□ -0.72
SRF1Q12516 TUB4YLR212C 1422 nt10.57□□□□□ -0.72
SRF1Q12516 AI5_BETAQ0075 1065 nt10.56□□□□□ -0.72
SRF1Q12516 PET20YPL159C 762 nt10.56□□□□□ -0.72
SRF1Q12516 AKR2YOR034C 2250 nt10.56□□□□□ -0.72
SRF1Q12516 YJL055WYJL055W 738 nt10.55□□□□□ -0.72
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