Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd8Q09XV5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd8Q09XV5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd8Q09XV5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd8Q09XV5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd8Q09XV5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd8Q09XV5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd8Q09XV5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd8Q09XV5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd8Q09XV5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd8Q09XV5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd8Q09XV5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd8Q09XV5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd8Q09XV5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd8Q09XV5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd8Q09XV5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd8Q09XV5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd8Q09XV5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd8Q09XV5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd8Q09XV5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd8Q09XV5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Chd8Q09XV5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Chd8Q09XV5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Chd8Q09XV5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Chd8Q09XV5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd8Q09XV5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd8Q09XV5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Chd8Q09XV5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd8Q09XV5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Chd8Q09XV5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Chd8Q09XV5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chd8Q09XV5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd8Q09XV5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd8Q09XV5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd8Q09XV5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd8Q09XV5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd8Q09XV5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd8Q09XV5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd8Q09XV5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd8Q09XV5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd8Q09XV5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chd8Q09XV5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd8Q09XV5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd8Q09XV5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd8Q09XV5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chd8Q09XV5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd8Q09XV5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chd8Q09XV5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chd8Q09XV5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd8Q09XV5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chd8Q09XV5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chd8Q09XV5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chd8Q09XV5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd8Q09XV5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd8Q09XV5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Chd8Q09XV5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd8Q09XV5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd8Q09XV5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd8Q09XV5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd8Q09XV5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chd8Q09XV5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chd8Q09XV5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd8Q09XV5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd8Q09XV5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chd8Q09XV5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chd8Q09XV5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd8Q09XV5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd8Q09XV5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd8Q09XV5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd8Q09XV5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd8Q09XV5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd8Q09XV5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd8Q09XV5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chd8Q09XV5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd8Q09XV5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd8Q09XV5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd8Q09XV5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chd8Q09XV5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Chd8Q09XV5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chd8Q09XV5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chd8Q09XV5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chd8Q09XV5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chd8Q09XV5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chd8Q09XV5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chd8Q09XV5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chd8Q09XV5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chd8Q09XV5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chd8Q09XV5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chd8Q09XV5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chd8Q09XV5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chd8Q09XV5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chd8Q09XV5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Chd8Q09XV5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd8Q09XV5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chd8Q09XV5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chd8Q09XV5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chd8Q09XV5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd8Q09XV5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Chd8Q09XV5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Chd8Q09XV5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms