Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Apba2P98084 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Apba2P98084 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Apba2P98084 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Apba2P98084 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Apba2P98084 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Apba2P98084 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Apba2P98084 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Apba2P98084 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Apba2P98084 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Apba2P98084 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Apba2P98084 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Apba2P98084 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Apba2P98084 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Apba2P98084 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Apba2P98084 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Apba2P98084 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Apba2P98084 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Apba2P98084 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Apba2P98084 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Apba2P98084 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Apba2P98084 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Apba2P98084 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Apba2P98084 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Apba2P98084 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Apba2P98084 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Apba2P98084 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Apba2P98084 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Apba2P98084 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Apba2P98084 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Apba2P98084 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Apba2P98084 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Apba2P98084 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Apba2P98084 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Apba2P98084 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Apba2P98084 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Apba2P98084 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Apba2P98084 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Apba2P98084 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Apba2P98084 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Apba2P98084 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Apba2P98084 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Apba2P98084 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Apba2P98084 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Apba2P98084 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Apba2P98084 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Apba2P98084 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Apba2P98084 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Apba2P98084 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Apba2P98084 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Apba2P98084 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Apba2P98084 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Apba2P98084 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Apba2P98084 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Apba2P98084 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Apba2P98084 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Apba2P98084 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Apba2P98084 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Apba2P98084 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Apba2P98084 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Apba2P98084 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Apba2P98084 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Apba2P98084 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Apba2P98084 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Apba2P98084 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Apba2P98084 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Apba2P98084 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Apba2P98084 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Apba2P98084 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Apba2P98084 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Apba2P98084 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Apba2P98084 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Apba2P98084 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Apba2P98084 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Apba2P98084 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Apba2P98084 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Apba2P98084 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Apba2P98084 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Apba2P98084 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Apba2P98084 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Apba2P98084 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Apba2P98084 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Apba2P98084 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Apba2P98084 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Apba2P98084 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Apba2P98084 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Apba2P98084 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Apba2P98084 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Apba2P98084 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Apba2P98084 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Apba2P98084 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Apba2P98084 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Apba2P98084 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Apba2P98084 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Apba2P98084 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Apba2P98084 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Apba2P98084 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Apba2P98084 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Apba2P98084 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Apba2P98084 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 361.8 ms