Protein–RNA interactions for Protein: P98063

Bmp1, Bone morphogenetic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp1P98063 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bmp1P98063 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bmp1P98063 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bmp1P98063 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bmp1P98063 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Bmp1P98063 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bmp1P98063 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bmp1P98063 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bmp1P98063 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bmp1P98063 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Bmp1P98063 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Bmp1P98063 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Bmp1P98063 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bmp1P98063 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bmp1P98063 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Bmp1P98063 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bmp1P98063 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Bmp1P98063 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bmp1P98063 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bmp1P98063 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bmp1P98063 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Bmp1P98063 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Bmp1P98063 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bmp1P98063 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bmp1P98063 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Bmp1P98063 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Bmp1P98063 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Bmp1P98063 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Bmp1P98063 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Bmp1P98063 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bmp1P98063 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bmp1P98063 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bmp1P98063 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bmp1P98063 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Bmp1P98063 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Bmp1P98063 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bmp1P98063 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Bmp1P98063 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bmp1P98063 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bmp1P98063 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bmp1P98063 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Bmp1P98063 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bmp1P98063 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bmp1P98063 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bmp1P98063 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bmp1P98063 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bmp1P98063 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bmp1P98063 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bmp1P98063 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Bmp1P98063 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bmp1P98063 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bmp1P98063 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bmp1P98063 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bmp1P98063 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bmp1P98063 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bmp1P98063 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Bmp1P98063 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bmp1P98063 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Bmp1P98063 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bmp1P98063 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bmp1P98063 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Bmp1P98063 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bmp1P98063 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Bmp1P98063 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Bmp1P98063 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Bmp1P98063 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Bmp1P98063 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Bmp1P98063 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Bmp1P98063 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bmp1P98063 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bmp1P98063 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bmp1P98063 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Bmp1P98063 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Bmp1P98063 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bmp1P98063 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bmp1P98063 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bmp1P98063 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bmp1P98063 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bmp1P98063 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bmp1P98063 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bmp1P98063 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bmp1P98063 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bmp1P98063 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bmp1P98063 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bmp1P98063 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bmp1P98063 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bmp1P98063 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bmp1P98063 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bmp1P98063 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bmp1P98063 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Bmp1P98063 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Bmp1P98063 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bmp1P98063 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bmp1P98063 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bmp1P98063 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bmp1P98063 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bmp1P98063 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bmp1P98063 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Bmp1P98063 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bmp1P98063 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms