Protein–RNA interactions for Protein: P97477

Aurka, Aurora kinase A, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkaP97477 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AurkaP97477 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
AurkaP97477 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AurkaP97477 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AurkaP97477 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AurkaP97477 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AurkaP97477 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AurkaP97477 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
AurkaP97477 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AurkaP97477 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AurkaP97477 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AurkaP97477 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AurkaP97477 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AurkaP97477 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AurkaP97477 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AurkaP97477 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AurkaP97477 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AurkaP97477 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AurkaP97477 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AurkaP97477 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AurkaP97477 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AurkaP97477 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AurkaP97477 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AurkaP97477 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AurkaP97477 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AurkaP97477 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AurkaP97477 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AurkaP97477 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AurkaP97477 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AurkaP97477 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AurkaP97477 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AurkaP97477 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AurkaP97477 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AurkaP97477 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AurkaP97477 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AurkaP97477 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AurkaP97477 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AurkaP97477 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AurkaP97477 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AurkaP97477 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AurkaP97477 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AurkaP97477 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AurkaP97477 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AurkaP97477 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AurkaP97477 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
AurkaP97477 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AurkaP97477 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AurkaP97477 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AurkaP97477 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AurkaP97477 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AurkaP97477 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
AurkaP97477 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AurkaP97477 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AurkaP97477 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AurkaP97477 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AurkaP97477 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AurkaP97477 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AurkaP97477 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AurkaP97477 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AurkaP97477 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AurkaP97477 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AurkaP97477 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AurkaP97477 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AurkaP97477 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AurkaP97477 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AurkaP97477 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AurkaP97477 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AurkaP97477 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AurkaP97477 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AurkaP97477 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AurkaP97477 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AurkaP97477 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AurkaP97477 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AurkaP97477 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AurkaP97477 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AurkaP97477 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AurkaP97477 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AurkaP97477 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AurkaP97477 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AurkaP97477 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AurkaP97477 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AurkaP97477 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AurkaP97477 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AurkaP97477 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AurkaP97477 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AurkaP97477 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AurkaP97477 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AurkaP97477 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AurkaP97477 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AurkaP97477 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AurkaP97477 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AurkaP97477 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AurkaP97477 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AurkaP97477 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AurkaP97477 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AurkaP97477 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AurkaP97477 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AurkaP97477 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
AurkaP97477 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AurkaP97477 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms