Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PtprvP70289 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PtprvP70289 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PtprvP70289 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PtprvP70289 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtprvP70289 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtprvP70289 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PtprvP70289 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PtprvP70289 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PtprvP70289 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PtprvP70289 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PtprvP70289 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PtprvP70289 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
PtprvP70289 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PtprvP70289 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PtprvP70289 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PtprvP70289 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PtprvP70289 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
PtprvP70289 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PtprvP70289 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PtprvP70289 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PtprvP70289 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PtprvP70289 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PtprvP70289 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
PtprvP70289 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PtprvP70289 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PtprvP70289 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PtprvP70289 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PtprvP70289 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PtprvP70289 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PtprvP70289 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
PtprvP70289 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PtprvP70289 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PtprvP70289 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PtprvP70289 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PtprvP70289 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PtprvP70289 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PtprvP70289 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PtprvP70289 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PtprvP70289 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PtprvP70289 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PtprvP70289 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PtprvP70289 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PtprvP70289 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PtprvP70289 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PtprvP70289 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PtprvP70289 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PtprvP70289 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PtprvP70289 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PtprvP70289 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PtprvP70289 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PtprvP70289 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
PtprvP70289 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
PtprvP70289 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PtprvP70289 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PtprvP70289 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PtprvP70289 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PtprvP70289 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PtprvP70289 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PtprvP70289 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprvP70289 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprvP70289 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtprvP70289 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtprvP70289 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtprvP70289 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PtprvP70289 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PtprvP70289 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PtprvP70289 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PtprvP70289 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PtprvP70289 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PtprvP70289 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PtprvP70289 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PtprvP70289 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PtprvP70289 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PtprvP70289 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PtprvP70289 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PtprvP70289 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PtprvP70289 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PtprvP70289 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PtprvP70289 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms