Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Itgb7P26011 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Itgb7P26011 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Itgb7P26011 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Itgb7P26011 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Itgb7P26011 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Itgb7P26011 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Itgb7P26011 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Itgb7P26011 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Itgb7P26011 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Itgb7P26011 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Itgb7P26011 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Itgb7P26011 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Itgb7P26011 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Itgb7P26011 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Itgb7P26011 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Itgb7P26011 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Itgb7P26011 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Itgb7P26011 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Itgb7P26011 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Itgb7P26011 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Itgb7P26011 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Itgb7P26011 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Itgb7P26011 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Itgb7P26011 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Itgb7P26011 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Itgb7P26011 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Itgb7P26011 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Itgb7P26011 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Itgb7P26011 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Itgb7P26011 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Itgb7P26011 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Itgb7P26011 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Itgb7P26011 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Itgb7P26011 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Itgb7P26011 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Itgb7P26011 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Itgb7P26011 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Itgb7P26011 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Itgb7P26011 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Itgb7P26011 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Itgb7P26011 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Itgb7P26011 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Itgb7P26011 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Itgb7P26011 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Itgb7P26011 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Itgb7P26011 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Itgb7P26011 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Itgb7P26011 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Itgb7P26011 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Itgb7P26011 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Itgb7P26011 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Itgb7P26011 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Itgb7P26011 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Itgb7P26011 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Itgb7P26011 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Itgb7P26011 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Itgb7P26011 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Itgb7P26011 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Itgb7P26011 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Itgb7P26011 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Itgb7P26011 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Itgb7P26011 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Itgb7P26011 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Itgb7P26011 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Itgb7P26011 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Itgb7P26011 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Itgb7P26011 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Itgb7P26011 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Itgb7P26011 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Itgb7P26011 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Itgb7P26011 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Itgb7P26011 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Itgb7P26011 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Itgb7P26011 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Itgb7P26011 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Itgb7P26011 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Itgb7P26011 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Itgb7P26011 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Itgb7P26011 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Itgb7P26011 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Itgb7P26011 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Itgb7P26011 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Itgb7P26011 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Itgb7P26011 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Itgb7P26011 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Itgb7P26011 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Itgb7P26011 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Itgb7P26011 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Itgb7P26011 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Itgb7P26011 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Itgb7P26011 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Itgb7P26011 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Itgb7P26011 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Itgb7P26011 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Itgb7P26011 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Itgb7P26011 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Itgb7P26011 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Itgb7P26011 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Itgb7P26011 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms