Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bmi1P25916 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bmi1P25916 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bmi1P25916 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bmi1P25916 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bmi1P25916 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Bmi1P25916 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bmi1P25916 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bmi1P25916 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Bmi1P25916 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bmi1P25916 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bmi1P25916 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Bmi1P25916 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bmi1P25916 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bmi1P25916 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bmi1P25916 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bmi1P25916 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bmi1P25916 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bmi1P25916 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bmi1P25916 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Bmi1P25916 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bmi1P25916 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bmi1P25916 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bmi1P25916 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bmi1P25916 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bmi1P25916 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bmi1P25916 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bmi1P25916 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bmi1P25916 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmi1P25916 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bmi1P25916 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bmi1P25916 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bmi1P25916 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bmi1P25916 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bmi1P25916 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bmi1P25916 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bmi1P25916 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bmi1P25916 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bmi1P25916 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bmi1P25916 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bmi1P25916 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bmi1P25916 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Bmi1P25916 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bmi1P25916 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bmi1P25916 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bmi1P25916 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bmi1P25916 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bmi1P25916 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bmi1P25916 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bmi1P25916 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bmi1P25916 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bmi1P25916 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bmi1P25916 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bmi1P25916 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bmi1P25916 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bmi1P25916 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bmi1P25916 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bmi1P25916 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bmi1P25916 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bmi1P25916 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bmi1P25916 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bmi1P25916 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bmi1P25916 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bmi1P25916 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bmi1P25916 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bmi1P25916 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bmi1P25916 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bmi1P25916 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bmi1P25916 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bmi1P25916 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bmi1P25916 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bmi1P25916 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bmi1P25916 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bmi1P25916 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bmi1P25916 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bmi1P25916 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bmi1P25916 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bmi1P25916 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bmi1P25916 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bmi1P25916 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bmi1P25916 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bmi1P25916 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 482.2 ms