Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Bmi1P25916 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Bmi1P25916 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Bmi1P25916 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Bmi1P25916 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Bmi1P25916 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Bmi1P25916 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Bmi1P25916 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bmi1P25916 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Bmi1P25916 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Bmi1P25916 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Bmi1P25916 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bmi1P25916 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Bmi1P25916 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bmi1P25916 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Bmi1P25916 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bmi1P25916 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bmi1P25916 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Bmi1P25916 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Bmi1P25916 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bmi1P25916 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bmi1P25916 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Bmi1P25916 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Bmi1P25916 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bmi1P25916 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Bmi1P25916 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Bmi1P25916 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bmi1P25916 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bmi1P25916 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Bmi1P25916 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bmi1P25916 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bmi1P25916 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Bmi1P25916 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bmi1P25916 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bmi1P25916 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bmi1P25916 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Bmi1P25916 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Bmi1P25916 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bmi1P25916 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Bmi1P25916 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Bmi1P25916 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Bmi1P25916 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bmi1P25916 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bmi1P25916 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Bmi1P25916 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bmi1P25916 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bmi1P25916 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bmi1P25916 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bmi1P25916 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bmi1P25916 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bmi1P25916 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bmi1P25916 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bmi1P25916 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bmi1P25916 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bmi1P25916 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bmi1P25916 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Bmi1P25916 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bmi1P25916 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bmi1P25916 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bmi1P25916 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bmi1P25916 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bmi1P25916 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bmi1P25916 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bmi1P25916 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Bmi1P25916 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bmi1P25916 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bmi1P25916 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Bmi1P25916 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bmi1P25916 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Bmi1P25916 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Bmi1P25916 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bmi1P25916 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bmi1P25916 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bmi1P25916 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bmi1P25916 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bmi1P25916 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bmi1P25916 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bmi1P25916 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bmi1P25916 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bmi1P25916 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bmi1P25916 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bmi1P25916 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bmi1P25916 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bmi1P25916 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Bmi1P25916 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bmi1P25916 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bmi1P25916 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bmi1P25916 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bmi1P25916 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bmi1P25916 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bmi1P25916 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bmi1P25916 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bmi1P25916 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bmi1P25916 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bmi1P25916 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bmi1P25916 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bmi1P25916 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bmi1P25916 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bmi1P25916 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bmi1P25916 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms