Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 RPS26-203ENST00000552361 623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.862e-9■■■■■ 56.1
RPS3P23396 RPS26-202ENST00000548590 1204 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-9■■■■■ 56.1
RPS3P23396 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 56
RPS3P23396 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.062e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.892e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.722e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.692e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.672e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 NUDT16L1-205ENST00000590460 709 ntTSL 317.89■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.442e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 NTMT1-206ENST00000481189 576 ntTSL 217.38■□□□□ 0.372e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 PRSS8-203ENST00000567531 729 ntTSL 317.15■□□□□ 0.342e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.262e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.242e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 NUP133-202ENST00000366678 779 ntTSL 516.47■□□□□ 0.232e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.112e-11■■■■■ 55.7
RPS3P23396 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 MRPL18-203ENST00000479638 600 ntTSL 513.95□□□□□ -0.182e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 MRPL18-204ENST00000480842 1075 ntTSL 313.8□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 NTMT1-208ENST00000486391 624 ntTSL 513.67□□□□□ -0.222e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 PRSS8-205ENST00000567833 1420 ntTSL 1 (best)13.14□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 MRPL18-202ENST00000476826 758 ntTSL 312.48□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 PRSS8-202ENST00000564025 521 ntTSL 212.03□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 CCDC170-201ENST00000239374 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 PRSS8-204ENST00000567797 552 ntTSL 410.33□□□□□ -0.762e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 CCDC170-202ENST00000537358 574 ntTSL 39.43□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 09e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 BLMH-205ENST00000578090 1483 ntTSL 213.56□□□□□ -0.249e-8■■■■■ 55.7
RPS3P23396 ATP6AP2-207ENST00000487051 1603 ntTSL 218.59■□□□□ 0.573e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.463e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-218ENST00000636639 2125 ntTSL 1 (best)17.21■□□□□ 0.353e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.343e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-206ENST00000486558 832 ntTSL 517.11■□□□□ 0.333e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.293e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.233e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 TIMM8B-202ENST00000507614 741 ntTSL 316.39■□□□□ 0.213e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.173e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.163e-12■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.163e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-216ENST00000636574 2027 ntTSL 515.85■□□□□ 0.133e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.123e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.123e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.113e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-219ENST00000636787 2012 ntTSL 515.55■□□□□ 0.083e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-209ENST00000635774 1995 ntTSL 515.29■□□□□ 0.043e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.013e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.033e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 YWHAB-203ENST00000428262 648 ntTSL 314.71□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.063e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-208ENST00000635734 1851 ntTSL 514.11□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.183e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.183e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.443e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 CDC123-209ENST00000498747 890 ntTSL 312.11□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 YWHAB-204ENST00000445830 556 ntTSL 211.39□□□□□ -0.592e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 TIMM8B-203ENST00000509359 1155 ntTSL 1 (best)9.57□□□□□ -0.883e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 TIMM8B-204ENST00000541231 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.883e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-204ENST00000447485 1254 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-230ENST00000637954 3593 ntTSL 29.37□□□□□ -0.913e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-231ENST00000637955 1084 ntTSL 57.48□□□□□ -1.213e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-210ENST00000635829 2479 ntTSL 57.04□□□□□ -1.283e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 CDC123-204ENST00000440613 685 ntTSL 56.3□□□□□ -1.43e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-203ENST00000436783 554 ntTSL 55.34□□□□□ -1.553e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 CDC123-208ENST00000497963 963 ntTSL 25.23□□□□□ -1.573e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 ATP6AP2-227ENST00000637614 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 54.25□□□□□ -1.733e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 SRP68-206ENST00000587864 577 ntTSL 22.86□□□□□ -1.953e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 TRAPPC4-207ENST00000526141 392 ntTSL 31.98□□□□□ -2.093e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 GYPB-209ENST00000508618 388 ntTSL 2-0.16□□□□□ -2.443e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 MANF-202ENST00000470900 1509 ntTSL 224.89■■□□□ 1.573e-8■■■■■ 55.6
RPS3P23396 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 55.6
RPS3P23396 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 55.6
RPS3P23396 AHCYL1-201ENST00000359172 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 55.6
RPS3P23396 VTN-203ENST00000542029 501 ntTSL 310.99□□□□□ -0.652e-16■■■■■ 55.1
RPS3P23396 ATP5C1-208ENST00000473809 530 ntTSL 22.33□□□□□ -2.041e-9■■■■■ 55
RPS3P23396 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.27e-9■■■■■ 55
RPS3P23396 TIMP1-203ENST00000441738 341 ntTSL 58.05□□□□□ -1.123e-14■■■■■ 55
RPS3P23396 HBE1-203ENST00000396895 578 ntTSL 55.43□□□□□ -1.541e-323■■■■■ 54.8
RPS3P23396 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.296e-10■■■■■ 54.8
RPS3P23396 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.226e-10■■■■■ 54.8
RPS3P23396 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.21□□□□□ -0.136e-10■■■■■ 54.8
RPS3P23396 NHSL2-205ENST00000631833 452 ntTSL 514.44□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 54.7
RPS3P23396 RPL9-211ENST00000514842 2153 ntTSL 511.41□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 54.7
RPS3P23396 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.842e-7■■■■■ 54.7
RPS3P23396 RPL9-208ENST00000508595 667 ntTSL 33.34□□□□□ -1.872e-7■■■■■ 54.7
RPS3P23396 PSMB5-201ENST00000334454 796 ntTSL 518.75■□□□□ 0.592e-8■■■■■ 54.4
RPS3P23396 ANGPTL4-209ENST00000599192 571 ntTSL 419.08■□□□□ 0.648e-8■■■■■ 54.3
RPS3P23396 ANGPTL4-211ENST00000601886 552 ntTSL 517.6■□□□□ 0.418e-8■■■■■ 54.3
RPS3P23396 ANGPTL4-210ENST00000601770 813 ntTSL 416.5■□□□□ 0.238e-8■■■■■ 54.3
RPS3P23396 ANGPTL4-208ENST00000598255 909 ntTSL 216.07■□□□□ 0.168e-8■■■■■ 54.3
RPS3P23396 ANGPTL4-204ENST00000594348 1021 ntTSL 214.61□□□□□ -0.078e-8■■■■■ 54.3
RPS3P23396 ANGPTL4-207ENST00000597137 582 ntTSL 414.05□□□□□ -0.168e-8■■■■■ 54.3
Retrieved 100 of 24,271 protein–RNA pairs in 947 ms