Protein–RNA interactions for Protein: P17534

Defa-rs2, Alpha-defensin-related sequence 2, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs2P17534 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Defa-rs2P17534 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Defa-rs2P17534 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Defa-rs2P17534 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Defa-rs2P17534 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Defa-rs2P17534 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Defa-rs2P17534 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Defa-rs2P17534 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Defa-rs2P17534 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Defa-rs2P17534 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Defa-rs2P17534 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Defa-rs2P17534 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Defa-rs2P17534 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Defa-rs2P17534 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Defa-rs2P17534 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Defa-rs2P17534 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Defa-rs2P17534 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Defa-rs2P17534 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Defa-rs2P17534 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Defa-rs2P17534 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Defa-rs2P17534 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Defa-rs2P17534 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Defa-rs2P17534 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Defa-rs2P17534 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Defa-rs2P17534 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Defa-rs2P17534 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Defa-rs2P17534 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Defa-rs2P17534 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Defa-rs2P17534 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Defa-rs2P17534 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Defa-rs2P17534 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Defa-rs2P17534 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Defa-rs2P17534 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Defa-rs2P17534 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Defa-rs2P17534 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Defa-rs2P17534 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Defa-rs2P17534 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Defa-rs2P17534 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Defa-rs2P17534 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Defa-rs2P17534 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Defa-rs2P17534 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Defa-rs2P17534 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Defa-rs2P17534 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Defa-rs2P17534 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Defa-rs2P17534 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Defa-rs2P17534 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Defa-rs2P17534 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Defa-rs2P17534 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Defa-rs2P17534 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Defa-rs2P17534 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Defa-rs2P17534 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Defa-rs2P17534 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Defa-rs2P17534 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Defa-rs2P17534 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Defa-rs2P17534 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Defa-rs2P17534 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Defa-rs2P17534 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Defa-rs2P17534 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Defa-rs2P17534 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Defa-rs2P17534 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Defa-rs2P17534 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Defa-rs2P17534 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Defa-rs2P17534 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Defa-rs2P17534 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Defa-rs2P17534 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Defa-rs2P17534 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Defa-rs2P17534 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Defa-rs2P17534 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Defa-rs2P17534 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Defa-rs2P17534 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Defa-rs2P17534 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Defa-rs2P17534 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Defa-rs2P17534 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Defa-rs2P17534 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Defa-rs2P17534 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Defa-rs2P17534 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Defa-rs2P17534 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Defa-rs2P17534 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Defa-rs2P17534 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Defa-rs2P17534 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Defa-rs2P17534 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Defa-rs2P17534 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Defa-rs2P17534 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Defa-rs2P17534 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Defa-rs2P17534 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Defa-rs2P17534 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Defa-rs2P17534 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Defa-rs2P17534 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Defa-rs2P17534 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Defa-rs2P17534 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Defa-rs2P17534 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Defa-rs2P17534 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Defa-rs2P17534 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Defa-rs2P17534 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Defa-rs2P17534 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Defa-rs2P17534 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Defa-rs2P17534 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Defa-rs2P17534 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Defa-rs2P17534 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Defa-rs2P17534 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms