Protein–RNA interactions for Protein: P11835

Itgb2, Integrin beta-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb2P11835 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb2P11835 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb2P11835 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb2P11835 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb2P11835 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb2P11835 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb2P11835 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb2P11835 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb2P11835 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb2P11835 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb2P11835 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb2P11835 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb2P11835 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb2P11835 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb2P11835 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb2P11835 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb2P11835 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb2P11835 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb2P11835 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb2P11835 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb2P11835 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb2P11835 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb2P11835 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb2P11835 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb2P11835 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb2P11835 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb2P11835 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb2P11835 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb2P11835 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb2P11835 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb2P11835 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb2P11835 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb2P11835 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb2P11835 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb2P11835 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb2P11835 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb2P11835 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb2P11835 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb2P11835 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb2P11835 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb2P11835 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb2P11835 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb2P11835 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb2P11835 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb2P11835 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb2P11835 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb2P11835 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb2P11835 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb2P11835 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb2P11835 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb2P11835 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb2P11835 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb2P11835 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb2P11835 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb2P11835 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb2P11835 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itgb2P11835 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb2P11835 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb2P11835 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb2P11835 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb2P11835 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb2P11835 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb2P11835 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb2P11835 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb2P11835 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb2P11835 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb2P11835 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb2P11835 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb2P11835 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb2P11835 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb2P11835 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb2P11835 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb2P11835 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb2P11835 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb2P11835 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb2P11835 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb2P11835 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb2P11835 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb2P11835 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb2P11835 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb2P11835 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb2P11835 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb2P11835 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb2P11835 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb2P11835 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb2P11835 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb2P11835 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb2P11835 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb2P11835 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb2P11835 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb2P11835 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb2P11835 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb2P11835 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms