Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smim22J3QP37 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smim22J3QP37 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smim22J3QP37 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smim22J3QP37 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smim22J3QP37 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smim22J3QP37 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smim22J3QP37 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smim22J3QP37 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smim22J3QP37 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Smim22J3QP37 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Smim22J3QP37 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smim22J3QP37 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smim22J3QP37 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smim22J3QP37 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smim22J3QP37 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smim22J3QP37 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smim22J3QP37 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smim22J3QP37 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smim22J3QP37 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smim22J3QP37 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smim22J3QP37 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smim22J3QP37 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smim22J3QP37 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smim22J3QP37 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smim22J3QP37 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smim22J3QP37 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Smim22J3QP37 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smim22J3QP37 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smim22J3QP37 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smim22J3QP37 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smim22J3QP37 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smim22J3QP37 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Smim22J3QP37 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Smim22J3QP37 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Smim22J3QP37 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Smim22J3QP37 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smim22J3QP37 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Smim22J3QP37 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smim22J3QP37 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smim22J3QP37 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smim22J3QP37 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Smim22J3QP37 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smim22J3QP37 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Smim22J3QP37 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smim22J3QP37 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smim22J3QP37 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smim22J3QP37 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Smim22J3QP37 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Smim22J3QP37 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smim22J3QP37 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smim22J3QP37 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smim22J3QP37 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smim22J3QP37 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smim22J3QP37 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smim22J3QP37 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Smim22J3QP37 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smim22J3QP37 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smim22J3QP37 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smim22J3QP37 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smim22J3QP37 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smim22J3QP37 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smim22J3QP37 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smim22J3QP37 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smim22J3QP37 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smim22J3QP37 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smim22J3QP37 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smim22J3QP37 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smim22J3QP37 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smim22J3QP37 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smim22J3QP37 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smim22J3QP37 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smim22J3QP37 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smim22J3QP37 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smim22J3QP37 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smim22J3QP37 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smim22J3QP37 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smim22J3QP37 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smim22J3QP37 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smim22J3QP37 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smim22J3QP37 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smim22J3QP37 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smim22J3QP37 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smim22J3QP37 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smim22J3QP37 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smim22J3QP37 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smim22J3QP37 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smim22J3QP37 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smim22J3QP37 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Smim22J3QP37 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smim22J3QP37 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Smim22J3QP37 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smim22J3QP37 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smim22J3QP37 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smim22J3QP37 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smim22J3QP37 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smim22J3QP37 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Smim22J3QP37 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smim22J3QP37 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smim22J3QP37 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms