Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp9yF8VPU6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp9yF8VPU6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp9yF8VPU6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp9yF8VPU6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp9yF8VPU6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp9yF8VPU6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp9yF8VPU6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp9yF8VPU6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp9yF8VPU6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp9yF8VPU6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp9yF8VPU6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp9yF8VPU6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp9yF8VPU6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp9yF8VPU6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp9yF8VPU6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp9yF8VPU6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp9yF8VPU6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp9yF8VPU6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp9yF8VPU6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp9yF8VPU6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp9yF8VPU6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp9yF8VPU6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp9yF8VPU6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp9yF8VPU6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp9yF8VPU6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp9yF8VPU6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp9yF8VPU6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp9yF8VPU6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp9yF8VPU6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
Usp9yF8VPU6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Usp9yF8VPU6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp9yF8VPU6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp9yF8VPU6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp9yF8VPU6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Usp9yF8VPU6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Usp9yF8VPU6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp9yF8VPU6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Usp9yF8VPU6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp9yF8VPU6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp9yF8VPU6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Usp9yF8VPU6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp9yF8VPU6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Usp9yF8VPU6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp9yF8VPU6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp9yF8VPU6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Usp9yF8VPU6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp9yF8VPU6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Usp9yF8VPU6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Usp9yF8VPU6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp9yF8VPU6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Usp9yF8VPU6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp9yF8VPU6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp9yF8VPU6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp9yF8VPU6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp9yF8VPU6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp9yF8VPU6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp9yF8VPU6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp9yF8VPU6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp9yF8VPU6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp9yF8VPU6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp9yF8VPU6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp9yF8VPU6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp9yF8VPU6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp9yF8VPU6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp9yF8VPU6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp9yF8VPU6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp9yF8VPU6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp9yF8VPU6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp9yF8VPU6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp9yF8VPU6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Usp9yF8VPU6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp9yF8VPU6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp9yF8VPU6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Usp9yF8VPU6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Usp9yF8VPU6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp9yF8VPU6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Usp9yF8VPU6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp9yF8VPU6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp9yF8VPU6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp9yF8VPU6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp9yF8VPU6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp9yF8VPU6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Usp9yF8VPU6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp9yF8VPU6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp9yF8VPU6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Usp9yF8VPU6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp9yF8VPU6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp9yF8VPU6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp9yF8VPU6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp9yF8VPU6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp9yF8VPU6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp9yF8VPU6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp9yF8VPU6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp9yF8VPU6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp9yF8VPU6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp9yF8VPU6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp9yF8VPU6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp9yF8VPU6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp9yF8VPU6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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