Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ryr1E9PZQ0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ryr1E9PZQ0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ryr1E9PZQ0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ryr1E9PZQ0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ryr1E9PZQ0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ryr1E9PZQ0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ryr1E9PZQ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ryr1E9PZQ0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ryr1E9PZQ0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ryr1E9PZQ0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ryr1E9PZQ0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ryr1E9PZQ0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ryr1E9PZQ0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ryr1E9PZQ0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ryr1E9PZQ0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ryr1E9PZQ0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ryr1E9PZQ0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ryr1E9PZQ0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ryr1E9PZQ0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ryr1E9PZQ0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ryr1E9PZQ0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ryr1E9PZQ0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ryr1E9PZQ0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ryr1E9PZQ0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ryr1E9PZQ0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ryr1E9PZQ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ryr1E9PZQ0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ryr1E9PZQ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ryr1E9PZQ0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ryr1E9PZQ0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ryr1E9PZQ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ryr1E9PZQ0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ryr1E9PZQ0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ryr1E9PZQ0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ryr1E9PZQ0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ryr1E9PZQ0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ryr1E9PZQ0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ryr1E9PZQ0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ryr1E9PZQ0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ryr1E9PZQ0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ryr1E9PZQ0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ryr1E9PZQ0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ryr1E9PZQ0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ryr1E9PZQ0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ryr1E9PZQ0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ryr1E9PZQ0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ryr1E9PZQ0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ryr1E9PZQ0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ryr1E9PZQ0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ryr1E9PZQ0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ryr1E9PZQ0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ryr1E9PZQ0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ryr1E9PZQ0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ryr1E9PZQ0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ryr1E9PZQ0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ryr1E9PZQ0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ryr1E9PZQ0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ryr1E9PZQ0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ryr1E9PZQ0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ryr1E9PZQ0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ryr1E9PZQ0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ryr1E9PZQ0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms