Protein–RNA interactions for Protein: E9PXQ7

Pcdh10, Protocadherin 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh10E9PXQ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Pcdh10E9PXQ7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Pcdh10E9PXQ7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
Pcdh10E9PXQ7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Pcdh10E9PXQ7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Pcdh10E9PXQ7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Pcdh10E9PXQ7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Pcdh10E9PXQ7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Pcdh10E9PXQ7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Pcdh10E9PXQ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Pcdh10E9PXQ7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Pcdh10E9PXQ7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
Pcdh10E9PXQ7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Pcdh10E9PXQ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Pcdh10E9PXQ7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Pcdh10E9PXQ7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Pcdh10E9PXQ7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Pcdh10E9PXQ7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Pcdh10E9PXQ7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Pcdh10E9PXQ7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Pcdh10E9PXQ7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
Pcdh10E9PXQ7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
Pcdh10E9PXQ7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Pcdh10E9PXQ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Pcdh10E9PXQ7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Pcdh10E9PXQ7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Pcdh10E9PXQ7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Pcdh10E9PXQ7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Pcdh10E9PXQ7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Pcdh10E9PXQ7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Pcdh10E9PXQ7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Pcdh10E9PXQ7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Pcdh10E9PXQ7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Pcdh10E9PXQ7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Pcdh10E9PXQ7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Pcdh10E9PXQ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
Pcdh10E9PXQ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Pcdh10E9PXQ7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Pcdh10E9PXQ7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Pcdh10E9PXQ7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
Pcdh10E9PXQ7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Pcdh10E9PXQ7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Pcdh10E9PXQ7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Pcdh10E9PXQ7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Pcdh10E9PXQ7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Pcdh10E9PXQ7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
Pcdh10E9PXQ7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Pcdh10E9PXQ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Pcdh10E9PXQ7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Pcdh10E9PXQ7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Pcdh10E9PXQ7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Pcdh10E9PXQ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Pcdh10E9PXQ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Pcdh10E9PXQ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Pcdh10E9PXQ7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Pcdh10E9PXQ7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Pcdh10E9PXQ7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Pcdh10E9PXQ7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Pcdh10E9PXQ7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
Pcdh10E9PXQ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Pcdh10E9PXQ7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Pcdh10E9PXQ7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Pcdh10E9PXQ7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Pcdh10E9PXQ7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Pcdh10E9PXQ7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Pcdh10E9PXQ7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
Pcdh10E9PXQ7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Pcdh10E9PXQ7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
Pcdh10E9PXQ7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Pcdh10E9PXQ7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Pcdh10E9PXQ7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Pcdh10E9PXQ7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Pcdh10E9PXQ7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Pcdh10E9PXQ7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
Pcdh10E9PXQ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Pcdh10E9PXQ7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Pcdh10E9PXQ7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Pcdh10E9PXQ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Pcdh10E9PXQ7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Pcdh10E9PXQ7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Pcdh10E9PXQ7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Pcdh10E9PXQ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Pcdh10E9PXQ7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Pcdh10E9PXQ7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Pcdh10E9PXQ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Pcdh10E9PXQ7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Pcdh10E9PXQ7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Pcdh10E9PXQ7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Pcdh10E9PXQ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Pcdh10E9PXQ7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Pcdh10E9PXQ7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Pcdh10E9PXQ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Pcdh10E9PXQ7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Pcdh10E9PXQ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Pcdh10E9PXQ7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Pcdh10E9PXQ7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Pcdh10E9PXQ7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Pcdh10E9PXQ7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Pcdh10E9PXQ7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Pcdh10E9PXQ7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms