Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptbn4E9PX29 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sptbn4E9PX29 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptbn4E9PX29 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sptbn4E9PX29 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptbn4E9PX29 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptbn4E9PX29 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptbn4E9PX29 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sptbn4E9PX29 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptbn4E9PX29 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sptbn4E9PX29 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Sptbn4E9PX29 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sptbn4E9PX29 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sptbn4E9PX29 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sptbn4E9PX29 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptbn4E9PX29 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sptbn4E9PX29 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sptbn4E9PX29 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sptbn4E9PX29 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptbn4E9PX29 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sptbn4E9PX29 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptbn4E9PX29 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptbn4E9PX29 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sptbn4E9PX29 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sptbn4E9PX29 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptbn4E9PX29 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptbn4E9PX29 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptbn4E9PX29 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptbn4E9PX29 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptbn4E9PX29 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptbn4E9PX29 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptbn4E9PX29 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptbn4E9PX29 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptbn4E9PX29 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptbn4E9PX29 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn4E9PX29 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn4E9PX29 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn4E9PX29 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn4E9PX29 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn4E9PX29 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn4E9PX29 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sptbn4E9PX29 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sptbn4E9PX29 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sptbn4E9PX29 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sptbn4E9PX29 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sptbn4E9PX29 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sptbn4E9PX29 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sptbn4E9PX29 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sptbn4E9PX29 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sptbn4E9PX29 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sptbn4E9PX29 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sptbn4E9PX29 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sptbn4E9PX29 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sptbn4E9PX29 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sptbn4E9PX29 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sptbn4E9PX29 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sptbn4E9PX29 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sptbn4E9PX29 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sptbn4E9PX29 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sptbn4E9PX29 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sptbn4E9PX29 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sptbn4E9PX29 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sptbn4E9PX29 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sptbn4E9PX29 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sptbn4E9PX29 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sptbn4E9PX29 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sptbn4E9PX29 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sptbn4E9PX29 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sptbn4E9PX29 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sptbn4E9PX29 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sptbn4E9PX29 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sptbn4E9PX29 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sptbn4E9PX29 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sptbn4E9PX29 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sptbn4E9PX29 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sptbn4E9PX29 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sptbn4E9PX29 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sptbn4E9PX29 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sptbn4E9PX29 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sptbn4E9PX29 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sptbn4E9PX29 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sptbn4E9PX29 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sptbn4E9PX29 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sptbn4E9PX29 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sptbn4E9PX29 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sptbn4E9PX29 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sptbn4E9PX29 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sptbn4E9PX29 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sptbn4E9PX29 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sptbn4E9PX29 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sptbn4E9PX29 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sptbn4E9PX29 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sptbn4E9PX29 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sptbn4E9PX29 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sptbn4E9PX29 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sptbn4E9PX29 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sptbn4E9PX29 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptbn4E9PX29 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sptbn4E9PX29 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sptbn4E9PX29 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms