Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcn1E9PVA8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcn1E9PVA8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gcn1E9PVA8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcn1E9PVA8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gcn1E9PVA8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcn1E9PVA8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcn1E9PVA8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gcn1E9PVA8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gcn1E9PVA8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcn1E9PVA8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gcn1E9PVA8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcn1E9PVA8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcn1E9PVA8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gcn1E9PVA8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcn1E9PVA8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcn1E9PVA8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcn1E9PVA8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gcn1E9PVA8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcn1E9PVA8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcn1E9PVA8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gcn1E9PVA8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcn1E9PVA8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcn1E9PVA8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gcn1E9PVA8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gcn1E9PVA8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcn1E9PVA8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcn1E9PVA8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcn1E9PVA8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcn1E9PVA8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcn1E9PVA8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcn1E9PVA8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcn1E9PVA8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcn1E9PVA8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcn1E9PVA8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcn1E9PVA8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcn1E9PVA8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcn1E9PVA8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcn1E9PVA8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcn1E9PVA8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcn1E9PVA8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcn1E9PVA8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcn1E9PVA8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcn1E9PVA8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcn1E9PVA8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gcn1E9PVA8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gcn1E9PVA8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gcn1E9PVA8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gcn1E9PVA8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gcn1E9PVA8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gcn1E9PVA8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gcn1E9PVA8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gcn1E9PVA8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcn1E9PVA8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcn1E9PVA8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcn1E9PVA8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcn1E9PVA8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcn1E9PVA8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcn1E9PVA8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcn1E9PVA8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcn1E9PVA8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcn1E9PVA8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gcn1E9PVA8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gcn1E9PVA8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gcn1E9PVA8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gcn1E9PVA8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcn1E9PVA8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcn1E9PVA8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gcn1E9PVA8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcn1E9PVA8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcn1E9PVA8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcn1E9PVA8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcn1E9PVA8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcn1E9PVA8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcn1E9PVA8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcn1E9PVA8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gcn1E9PVA8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcn1E9PVA8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcn1E9PVA8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcn1E9PVA8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcn1E9PVA8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcn1E9PVA8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcn1E9PVA8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcn1E9PVA8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcn1E9PVA8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcn1E9PVA8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcn1E9PVA8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcn1E9PVA8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcn1E9PVA8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcn1E9PVA8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcn1E9PVA8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcn1E9PVA8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcn1E9PVA8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcn1E9PVA8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcn1E9PVA8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcn1E9PVA8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcn1E9PVA8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcn1E9PVA8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcn1E9PVA8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcn1E9PVA8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 318.3 ms