Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
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