Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
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