Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NECAP2Q9NVZ3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NECAP2Q9NVZ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms