Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP8A1Q9Y2Q0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms