Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plxnb3Q9QY40 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Plxnb3Q9QY40 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Plxnb3Q9QY40 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms