Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Xrn1P97789 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Xrn1P97789 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Xrn1P97789 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms