Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF38BQ5VTL8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF38BQ5VTL8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms