Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf6Q3TWW8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf6Q3TWW8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms