Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
Srsf6Q3TWW8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Srsf6Q3TWW8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Srsf6Q3TWW8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Srsf6Q3TWW8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Srsf6Q3TWW8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Srsf6Q3TWW8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Srsf6Q3TWW8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Srsf6Q3TWW8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Srsf6Q3TWW8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Srsf6Q3TWW8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Srsf6Q3TWW8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Srsf6Q3TWW8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Srsf6Q3TWW8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Srsf6Q3TWW8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Srsf6Q3TWW8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Srsf6Q3TWW8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Srsf6Q3TWW8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Srsf6Q3TWW8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Srsf6Q3TWW8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Srsf6Q3TWW8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Srsf6Q3TWW8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Srsf6Q3TWW8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Srsf6Q3TWW8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Srsf6Q3TWW8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Srsf6Q3TWW8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Srsf6Q3TWW8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Srsf6Q3TWW8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Srsf6Q3TWW8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Srsf6Q3TWW8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Srsf6Q3TWW8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Srsf6Q3TWW8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Srsf6Q3TWW8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Srsf6Q3TWW8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Srsf6Q3TWW8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Srsf6Q3TWW8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Srsf6Q3TWW8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Srsf6Q3TWW8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Srsf6Q3TWW8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Srsf6Q3TWW8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Srsf6Q3TWW8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Srsf6Q3TWW8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Srsf6Q3TWW8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Srsf6Q3TWW8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Srsf6Q3TWW8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Srsf6Q3TWW8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Srsf6Q3TWW8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Srsf6Q3TWW8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Srsf6Q3TWW8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Srsf6Q3TWW8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Srsf6Q3TWW8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Srsf6Q3TWW8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Srsf6Q3TWW8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Srsf6Q3TWW8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Srsf6Q3TWW8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Srsf6Q3TWW8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Srsf6Q3TWW8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Srsf6Q3TWW8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Srsf6Q3TWW8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Srsf6Q3TWW8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Srsf6Q3TWW8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Srsf6Q3TWW8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Srsf6Q3TWW8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Srsf6Q3TWW8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Srsf6Q3TWW8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Srsf6Q3TWW8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Srsf6Q3TWW8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Srsf6Q3TWW8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Srsf6Q3TWW8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Srsf6Q3TWW8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Srsf6Q3TWW8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Srsf6Q3TWW8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Srsf6Q3TWW8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Srsf6Q3TWW8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Srsf6Q3TWW8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Srsf6Q3TWW8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Srsf6Q3TWW8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Srsf6Q3TWW8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Srsf6Q3TWW8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Srsf6Q3TWW8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srsf6Q3TWW8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Srsf6Q3TWW8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Srsf6Q3TWW8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Srsf6Q3TWW8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Srsf6Q3TWW8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Srsf6Q3TWW8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Srsf6Q3TWW8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Srsf6Q3TWW8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Srsf6Q3TWW8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Srsf6Q3TWW8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Srsf6Q3TWW8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Srsf6Q3TWW8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Srsf6Q3TWW8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Srsf6Q3TWW8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Srsf6Q3TWW8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Srsf6Q3TWW8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Srsf6Q3TWW8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
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