Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TVP23BQ9NYZ1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TVP23BQ9NYZ1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms