Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXND1Q9Y4D7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms